Tujuan utama Program Studi Doktoral Teknik Fisika adalah mendidik sumber daya manusia dengan penguasaan keilmuan dan kemampuan dalam riset yang sesuai dengan capaian pembelajaran (learning outcomes) level 9 pada Kerangka Kualifikasi Nasional Indonesia (KKNI). Secara spesifik, profil lulusan doktoral Teknik Fisika sekurang- kurangnya:

• Memiliki kemampuan untuk mengembangkan diri menjadi seorang profesional yang sukses pada posisi yang kompetitif baik di industri, instansi pemerintah, lembaga penelitian, maupun dunia akademik sesuai sengan keilmuan Teknik Fisika yang ditekuninya.
• Memiliki kemampuan mengelola, memimpin, dan mengembangkan riset serta pengembangan yang bermanfaat bagi kemaslahatan umat manusia, serta mampu mendapat pengakuan nasional dan internasional.
• Memiliki kemampuan menjadi peneliti yang menciptakan, menumbuhkan serta mengembangkan ilmu dan teknologi terkini serta mampu menjunjung tinggi profesionalisme, etika, serta hasrat untuk belajar sepanjang hayat.